Япония, XXII век. С целью предотвращения преступлений была разработана система Sibyl. Это позволило объективно определять уровень угрозы у каждого гражданина путем проверки его психического состояния на наличие признаков преступного умысла. Данный метод получил название Психопаспорт. Поддерживают закон инспекторы, которые при малейшем признаке недоброжелательности у гражданина имеют право незамедлительно применять против него оружие.
Проигрывая войну армии небесных ангелов, демоны ада находятся на грани краха. В качестве последней отчаянной попытки переломить ход войны демоны отправляют Масатору Акуцу к людям на Землю. Маскируясь под старшеклассника, он должен завербовать личность, способную привести демонов к победе. Одноклассница Лили Аманэ представляется Акуцу идеальным кандидатом, но она, как назло, оказывается ангелом, а постепенно возникающие романтические чувства осложняют и без того непростую
«Майор» Мотоко Кусанаги, Бато и другие сотрудники секретного Девятого отдела разрешают международный кризис с заложниками, ведут охоту на самовольно покинувший полигон шагающий танк и расследуют серию самоубийств андроидов устаревшей модели. Когда погибает старый друг Тогусы, оперативники выходят на след загадочного хакера по кличке Смеющийся Человек.