1983 год. В деревне Хинамидзава выявлена вспышка неизвестного вируса, из-за чего деревушку вместе с жителями закрывают на карантин. Кэити, Рена и их друзья пытаются разобраться в ситуации, еще не догадываясь с каким жутким врагом им придётся столкнуться на этот раз.
Человек в маске, представленный зрителю как Учиха Мадара, решает завладеть силой девятихвостого, для чего проникает в Коноху, где сталкивается с Наруто и Сакурой. С помощью силы глаз использует технику «Цукиёми», которая погружает героев в параллельную реальность, где всё наоборот, родители Наруто живы, Сакура дочь героев деревни, Саске никуда не уходил, Акацки защищают Коноху, и всё кажется идеально. Вот только тот ли это мир, который хочет защитить Наруто, его ли это
