Жизнь юного Ноктиса изменилась после нападения шестирукой женщины-змеи. Этот монстр отнял жизнь его родных и чуть не погубил его самого. Благодаря своевременной помощи Ноктис был спасён и даже обрёл новый дом, но ненадолго. Спустя несколько лет война, шедшая между его королевством и империей, решилась в пользу последней. Ноктис пробирается в Столицу, оказавшуюся под властью врага, скрывая свою личность и вступая в бесконечную борьбу с имперскими отрядами киборгов.
Крутые шпионы Курума и Ботан Негоро объединяются для сверхсекретной миссии по спасению мира. Их цель — найти фрагменты изобретения Николы Теслы, которые способны уничтожить нашу планету. Но за столь ценными предметами уже охотятся спецслужбы других стран и наёмники теневых организаций.
Восьмилетняя Катарина Клас, единственная дочь герцога, однажды ударяется головой о камень и вспоминает, что на самом деле она была отаку и умерла по дороге в школу после ночи, проведенной за игрой в симулятор свиданий Fortune Lover. Заметив, что ее нынешнее окружение кажется странно знакомым, Катарина с ужасом осознает, что она теперь — главная злодейка в любимой игре.