Будущее. Одри Бёрн, последняя представительница великой тиранической семьи, крадёт ключ к таинственному устройству под названием «Шкатулка Лапласа», которое, по слухам, обладает способностью определять ход Вселенной. Поиски устройства приводят её в колонию Сторона 4, где она сталкивается с обычным подростком Банагером Линксом. А вскоре колония подвергается нападению.
В старшей школе искусств университета Суймэй есть множество общежитий, а есть доходный дом «Сакурасо». Если в общежитиях действуют строгие правила, то в «Сакурасо» можно все, недаром ее местное прозвище – сумасшедший дом. Так как в искусстве гений и сумасшествие всегда где-то рядом, то обитатели вишневого сада - талантливые и интересные ребята, слишком уж выбивающиеся из общего болота. Взять хотя бы шумную Мисаки, что продает мейджор-студиям собственное аниме, ее друга и
Уборка снега холодной зимой, работа на ферме жарким летом — далеко не полный перечень повседневных забот Римуру, когда он не занят сражениями с монстрами.
Зачем четверо студентов полезли в заброшенную школу? Сейчас вспоминать уже поздно, ибо один из четверки мертв, а другая явно одержима злыми духами. Харука Одзава, подруга пострадавшей и также участница неудачного похода, обращается за помощью к нелюдимому парню по имени Якумо Сайто, который, как поговаривают в кампусе, «что-то такое может». Как выясняется после ряда опасных приключений, кроваво-красный левый глаз ее нового знакомого и правда может видеть духов умерших, а сам
Обычный служащий финансовой компании Сатору Миками погибает, защищая коллегу от грабителя с ножом. После смерти Сатору попадает в фэнтезийный мир, в котором он предстаёт в виде комка слизи средних размеров по имени Римуру, наделённой немалым разумом. Отныне Римуру будет жить в мире, полном разных рас, в надежде построить однажды страну, где к каждой расе будут относиться одинаково.
Макото и его союзники выросли и прошли через много встреч, расставаний и испытаний. Их борьба ведется уже не ради мира, а ради их самих. Они продолжают сражаться, веря, что в конце их ждут мирные дни. Однако Юки утверждает, что разрушение — это судьба человечества, которую люди должны принять.
Противостояние главного героя и команды SEES со странными монстрами, называемыми Тенями, приближается к концу. Макото и его сторонники ведут сражения насмерть, чтобы положить конец Тёмному Часу. В окружении Макото появляется загадочный студент по обмену. Шестерни судьбы начинают вращаться с каждым новым утром для SEES. Между героями нарастает напряжение.