Талантливый юный пилот Клаус и его штурман, очаровательная Лави, попадают в невероятный круговорот событий: они оказываются в самом центре кровопролитной битвы между воздушными флотилиями двух соперничающих государств, участвуют в головокружительных гонках на ваншипах, спасают жизнь таинственной девочке Аль и, в итоге, оказываются на борту «Сильваны» - легендарной летающей крепости под командованием загадочного капитана Алекса Роу.
В недалеком 2029 году сети и компьютеры развились до того, что появилась возможность создавать высокотехнологичных киборгов с полной интеграцией в Сеть. Главная героиня Кусанаги Мотоко - киборг, с человеческим разумом внутри кибернетического тела, майор Девятого отдела, созданного для спецопераций правительства.В Сети объявляется некий Кукловод, манипулирующий людьми через ту же Сеть, заставляя их действовать в его интересах. Его поимкой и занимается Девятый отдел. Но не все
События фильма разворачиваются через год после Четвертой мировой войны. Киборг-хакер экстраординарный Мотоко Кусанаги из 501-го секретного военного подразделения оказывается вовлечен в расследование событий, связанных с разрушительной бомбардировкой.
В апреле 2009 года загадочная форма жизни, названая Имаго, начала захват Земли. Уже 45 лет идёт война, но атаки Имаго невозможно остановить, поэтому человечество приготовилось к последнему решающему удару.
Брокер, а возможно, и создатель вируса изменяющего память, приезжает в Японию и использует его, чтобы уничтожить целую авиакомпанию, убив всех находившихся на борту. Майор и ее команда организуют операцию по поимке так называемого Пироманьяка.
После окончания очередной мировой войны наука сделала невероятные шаги - теперь каждый человек может продлевать свою жизнь с помощью кибернетических частей тела. Все жители планеты связаны в общую сеть под названием Призраки, и широко распространились кибератаки на отдельных людей с целью кражи их памяти и тел. После убийства премьер-министра Японии майор Мотоко Кусанаги и её Девятый отдел выходят на след киберпреступников.
